Ten, kto pozná tajomstvo života a smrti, má moc. Kniha duší je voľným pokračovaním úspešného bestselleru Knižnica mŕtvych. Opäť sa stretáme s Willom Piperom, teraz už bývalým agentom FBI, ktorého život významne ovplyvnil spletitý prípad Posledný súd. Vďaka nemu sa nielen oženil s bývalou partnerkou Nancy, ale po podpísaní dohody o mlčanlivosti aj predčasne odišiel do penzie. Je učenlivým otcom šesťmesačného Phillipa a usiluje viesť pokojný rodinný život. Jedného dňa si všimne, že ho sledujú dvaja muži v prepychovom obytnom autobuse s evidenčným číslom štátu Nevada. Tam sa nachádza Priestor 51 a Knižnica mŕtvych – supertajný projekt americkej vlády, ktorý súvisel s nedoriešeným prípadom Posledný súd.

V tej chvíli Will ešte netuší, že sa doň znova zapletie. Na aukcii sa totiž objaví stratená kniha s vročením 1527, o ktorú má odrazu záujem akosi priveľa ľudí! Shakespeare, Ján Kalvín, Nostradamus – slávne osobnosti histórie prostredníctvom záhadných indícií vstupujú do súčasnosti, v ktorej opäť ide o život ľuďom verným pravde. Mocní tohto sveta totiž chcú údaje z Knižnice mŕtvych zneužiť na upevnenie politického vplyvu.